Η μονάδα παραγωγής Βιοντίζελ της ΒΙΟΜΑΚ Α.Β.Ε.Τ.Ε. μπορεί να χρησιμοποιεί ως πρώτη ύλη πρωτογενή σπορέλαια, ανακυκλώσιμα φυτικά έλαια, ζωικά λίπη και κτηνοτροφικά απόβλητα. Πρόκειται για μια καθετοποιημένη μονάδα παραγωγής με συνεχή έλεγχο σε κάθε στάδιο της, σε πλήρη ανάπτυξη η μονάδα παραγωγής Βιοντίζελ έχει δυναμική παραγωγής 20.000 μετρικών τόνων προϊόντος ανά χρόνο.

Το προϊόν που θα παραχθεί εντάσσεται εξαρχής στα Βιοκαύσιμα 2ης γενιάς και η μονάδα παραγωγής είναι σε θέση για άμεση τροποποίηση για παραγωγή 3ης γενιάς Βιοκαυσίμων με γνώμονα την περαιτέρω έρευνα και ανάπτυξη στον κλάδο των εναλλακτικών καυσίμων και την προστασία του περιβάλλοντος συμπεριλαμβανομένων και των προκλήσεων του γεωπολιτικού περιβάλλοντος.